Newick: agrupa las especies emparentadas entre paréntesis; añade :0.5 tras un nombre para indicar la longitud de rama. O simplemente lista las especies, una por línea.
Pega una cadena Newick o simplemente enumera tus especies una por línea, y este creador de árboles filogenéticos dibuja un árbol evolutivo limpio en tu navegador: nodos para los ancestros comunes, puntas para las especies y un resumen de una línea con cuántas especies y puntos de ramificación tiene el árbol. Cambia a la vista de longitudes de rama para ver la divergencia a escala, y descarga el dibujo en PNG, JPG o SVG. Es un generador de árboles filogenéticos para deberes, diapositivas y artículos por igual, sin cuenta y sin nada que instalar.
Newick es el formato de texto que lee todo programa de filogenética. Las especies que comparten un ancestro van entre paréntesis, los grupos se anidan dentro de otros grupos y un punto y coma cierra el árbol. (((Humano,Chimpancé),Gorila),Orangután); dice que humano y chimpancé se separaron más recientemente, que el gorila se ramificó antes que ellos y el orangután antes que todos. Los nombres pueden ir entre comillas o usar guiones bajos en lugar de espacios, y una etiqueta escrita tras un paréntesis de cierre da nombre a ese ancestro.
Una lista sencilla es más rápida cuando solo conoces el orden de parentesco. Escribe las especies una por línea, con los parientes más cercanos juntos, y el creador empareja los vecinos en un árbol equilibrado. Cinco nombres dan un árbol con cuatro puntos de ramificación; la cadena Newick generada aparece bajo la entrada para que ajustes la agrupación a mano.
Añade :0.6 tras un nombre o un grupo para dar a esa rama una longitud, medida en sustituciones por sitio, millones de años o lo que usen tus datos. Cuando todas las ramas llevan longitud, aparece sobre el árbol el conmutador Longitud de ramas. En esa vista cada especie se sitúa a su distancia total desde la raíz, así que una punta muy a la derecha ha cambiado más, y dos puntas alineadas han divergido durante el mismo tiempo. Sin longitudes el árbol es un cladograma: solo el orden de ramificación tiene significado y las puntas se alinean.
Un árbol con n especies tiene n − 1 puntos de ramificación cuando todas las divisiones son en dos. Tres o más especies que cuelgan de un mismo nodo, (A,B,C), forman una politomía, una división sin resolver que el creador dibuja como un abanico.
El árbol se dibuja como SVG, así que las descargas en PNG y JPG se generan a doble resolución para diapositivas y fichas, y el archivo SVG se abre en Inkscape o Illustrator para seguir editándolo. El botón de compartir copia un enlace que contiene el texto Newick, y el mismo árbol se abre para cualquiera que lo siga. Para un árbol que muestre relaciones sin ninguna longitud, el creador de cladogramas empieza con un ejemplo clásico de vertebrados.
Pon entre paréntesis las especies que comparten un ancestro común, sepáralas con comas y termina con punto y coma: ((Humano,Chimpancé),Gorila); significa que humano y chimpancé son los más cercanos y que el gorila se les une después. Añade dos puntos y un número tras un nombre o un grupo para indicar su longitud de rama, como en Humano:0.6.
Un cladograma muestra solo el orden de ramificación, así que todas las puntas se alinean a la derecha. Un filograma dibuja cada rama a escala según su longitud, que representa tiempo o cantidad de cambio genético. El creador dibuja un cladograma por defecto y ofrece la vista de longitudes de rama cuando todas las ramas tienen longitud.
Sí. Escribe una especie por línea y la herramienta empareja los nombres vecinos en un árbol equilibrado. Ordena la lista de modo que las especies que quieres agrupar queden juntas, y después edita la cadena Newick generada para afinar la ramificación.
Un punto azul es un nodo, el ancestro común más reciente de todo lo que queda a su derecha. Un punto verde es una punta, una de las especies que introdujiste. Cualquier etiqueta que escribas tras un paréntesis de cierre aparece junto a su nodo como nombre del grupo.
Elige PNG o JPG para diapositivas y documentos o SVG para editarlo en un programa vectorial, y pulsa Descargar. El botón de compartir copia un enlace que lleva el texto del árbol, así que el mismo árbol se abre para cualquiera que lo siga.